טריפסין מבקע את הקשר הפפטיד בין קבוצת הקרבוקסיל של ארגינין או קבוצת הקרבוקסיל של ליזין וקבוצת האמינו של חומצת האמינו הסמוכה. קצב הביקוע מתרחש לאט יותר כאשר שאריות הליזין והארגינין צמודות לחומצות אמינו חומציות ברצף או בציסטין.
איפה טריפסין מבקע חומצות אמינו?
טריפסין מבקע פפטידים ב- צד C-טרמינלי של שאריות חומצות אמינו ליזין וארגינין. אם שארית פרולין נמצאת בצד הקרבוקסילי של אתר המחשוף, המחשוף לא יתרחש.
איזה רצף חתך טריפסין?
Trypsin Cleaves בלעדי C-טרמינל לשאריות ארגינין וליזין כמעט כל הפרויקטים בקנה מידה גדול בפרוטאומיקה מבוססת ספקטרומטריית המונים משתמשים בטריפסין כדי להמיר תערובות חלבון לפפטיד קל יותר לניתוח אוכלוסיות.
באיזה חומצות אמינו חותכים טריפסין וכימוטריפסין?
טריפסין חותך ב- ליזין וארגינין, בעוד כימוטריפסין. חותכים בטירוזין, פנילאלנין ובטריפטופן.. איך האנזים יודע לחתוך שם? הצע חלופה לאספרטט והיסטידין בטריאדה הקטליטית.
איזה חומצות אמינו מבקע פפסין?
פפסין מבקע קשרי פפטידים בצד האמינו-טרמינלי של שיירי חומצות האמינו המחזוריות ( טירוזין, פנילאלנין וטריפטופן), ומפרק את שרשראות הפוליפפטידים לפפטידים קטנים יותר (Fange ו- גרוב, 1979).
