כל חומצות האמינו נמצאות בסליל α, אך גליצין ופרולין אינם שכיחים, מכיוון שהם מערערים את הליקס α. גליצין פטור מאילוצים סטריים רבים מכיוון שחסר לו פחמן β. … פרולין, לעומת זאת, נוקשה מדי.
איזו חומצת אמינו לא נמצאת בסלילי אלפא?
Proline לא נמצא במבנה האלפא סליל של החלבונים, מכיוון שיש לו מבנה מחזורי מיוחד (זו חומצת אימינו לא חומצת אמינו) לסוג זה של מבנה משני יש רוחב ספציפי ומספר ספציפי של שאריות חומצות אמינו / סיבוב. לכן פרולין נחשב כמפסק סליל אלפא.
למה גליצין הוא שובר אלפא סליל?
פרולין וגליצין ידועים לפעמים בתור "שוברי סליל" מכיוון שהם משבשים את הסדירות של מבנה עמוד השדרה הסליל של α; עם זאת, לשניהם יש יכולות קונפורמציות יוצאות דופן ונמצאים בדרך כלל בתורות.
איפה גליצין בסליל אלפא?
יש שלושה מיקומים במוטיב הסליל-סיבוב-סליל שנשמרים מאוד. אלנין נמצא בדרך כלל בעמדה 5 בתוך סליל α הראשון; גליצין נמצא ב- עמדה 9, המיקום הראשון של הסיבוב; ולין או איזולאוצין נמצא בדרך כלל בעמדה 15 בתוך סליל ה-α השני.
האם שאריות גליצין נמצאות בעיקר בסליל אלפא?
גליצין, עם קונפורמציות השרשרת העיקריות הרבות האפשריות שלו, נמצא גם לעתים רחוקות בסליל. בידיעה מה הסבירות שחומצת אמינו תתרחש בסליל אלפא (מה שנקרא נטיות הסליל), ניתן לחזות היכן מתרחשים סלילים ברצף חלבונים.
