SDS נקשר בחוזקה ל לשאריות המטען החיובי וההידרופוביות של חלבונים דרך קבוצות הסולפט ושרשראות האלקיל שלו , בהתאמה13 בהתאם, זהו חומר ניקוי רב ערך בתחום הביולוגיה המבנית ומחקרי קיפול/פיתוח חלבונים.
מה SDS עושה לחלבון?
SDS הוא חומר פעיל שטח אמפיפתי. זה מטבע חלבונים על ידי קשירה לשרשרת החלבון עם זנב הפחמימנים שלו, חושף אזורים קבורים בדרך כלל וציפוי שרשרת החלבון במולקולות פעילי שטח. קבוצת הראשים הקוטביים של SDS מוסיפה יתרון נוסף לשימוש בדנטורנט זה.
איך SDS נקשר לחומצות אמינו?
ל-SDS יש זנב הידרופובי שמקיים אינטראקציה חזקה עם שרשראות חלבון (פוליפפטיד).מספר מולקולות SDS שנקשרות לחלבון הוא פרופורציונלי למספר חומצות האמינו המרכיבות את החלבון כל מולקולת SDS תורמת שני מטענים שליליים, מכריעה כל מטען שיש לחלבון.
האם SDS מצפה חלבונים?
SDS גם מצפה את החלבון במטען שלילי אחיד, המסווה את המטענים הפנימיים על קבוצות ה-R. SDS נקשר באופן די אחיד לחלבונים הליניאריים (בסביבות 1.4 גרם SDS/ 1 גרם חלבון), כלומר המטען של החלבון הוא כעת פרופורציונלי בערך למשקלו המולקולרי.
איך SDS נותן לחלבון מטען שלילי?
SDS הוא חומר ניקוי המכיל שרשרת אליפטית ארוכה וקבוצת סולפט. חומר ניקוי זה יוצר אינטראקציה עם חלבונים דנטורתיים כדי ליצור קומפלקס בעל מטען שלילי חזק (המטען השלילי הנובע מה-SO42 − קבוצות של SDS). החלבונים עוברים תחילה דנטורציה בחום ולאחר מכן מוסיפים את ה-SDS בעודף גדול.
