BigWig הוא פורמט קובץ להצגת נתונים צפופים ורציפים במסלול של דפדפן גנום, שנוצר על ידי המרה מפורמט Wiggle (WIG). פורמט BigWig מתואר באתר האינטרנט של UCSC Genome Bioinformatics, ומדריך פורמט הקבצים של Broad Institute מספק מידע נוסף.
מהו פורמט bigWig?
פורמט bigWig הוא להצגת נתונים צפופים ורציפים שיוצגו כגרף קבצי BigWig נוצרים בתחילה מקבצים מסוג WIG, באמצעות תוכנית UCSC wigToBigWig. לחלופין, ניתן ליצור קבצי bigWig מקובצי bedGraph, באמצעות תוכנית UCSC bedGraphToBigWig.
איך אני משתמש בקובץ bigWig?
הזז את קובץ bigWig החדש שנוצר (myBigWig.bw) למיקום http, https או ftp נגיש לאינטרנט. הדבק את כתובת האתר בטופס הזנת המסלול המותאם אישית או בנה רצועה מותאמת אישית באמצעות קו מסלול יחיד. הדבק את שורת המסלול המותאמת אישית בתיבת הטקסט בדף ניהול המסלול המותאם אישית.
מהו רצועת bigWig?
BigWig Tracks הם מסלולים לאותות מתמשכים על פני כל הגנום. הם מתאימים להצגת תוצאות ניסוי "גולמיות" שונות כגון אותות ChIP-Seq, אותות RNA-Seq וכו'.
איך אני יוצר קובץ bigWig?
ישנן מספר דרכים ליצור קבצי ביגווי. זה בדרך כלל כרוך בהמרה של. קובץ bam למסלול נדנוד (. פאה) ולאחר מכן המרת מסלול הנדנוד ל-Bigwig בינארי (.
