ב-11 ביוני 2005, במהלך ראיון ברדיו של ה-BBC, כשנשאל אם הוא נהנה לעבוד על דוקטור הו, אקלסטון הגיב באומרו, "מעורב, אבל זה סיפור ארוך." הסיבות של אקלסטון לעזיבת התפקיד ממשיכות להיות מתווכחות בעיתונים של בריטניה: ב-4 באוקטובר 2005 אמר אלן דייויס לדיילי טלגרף כי …
למה כריסטופר אקלסטון עזב את ד"ר Who?
למרות ההצלחה של תחיית הדוקטור הו, אקלסטון עזב את התכנית למרבה לשמצה אחרי סדרה אחת בלבד בגלל תסכול וחילוקי דעות מאחורי הקלעים עם מפיקים לגבי אופן ניהול התכנית.
למה כריסטופר אקלסטון לא אהב את דוקטור הו?
שמועות ראשוניות הצביעו על כך שאקלסטון החליט להישאר לעונה אחת בלבד כדי להימנע מלהיות מדורג בתור הדוקטור.… אקלסטון אמר לחדשות ה-BBC ש כבר לא נוח לו לעבוד על התוכנית, לאור התרבות שכל הצוות והצוות נאלצו לעבוד בה.
האם כריסטופר אקלסטון הוא אדם נחמד?
אחרי הכל, הוא שחקן, אז הוא אוהב קהל - והוא מפקד על חדר כשהוא מספר סיפור. אבל בסך הכל, הוא נראה הגון עמוק ומתחשב ביסודיות. כנות, יחד עם יושרה, כבוד - ומנצ'סר יונייטד - חשובים מאוד לאקלסטון.
האם כריסטופר אקלסטון היה מעריץ של דוקטור הו?
אקלסטון עמד בהבטחתו לא לפגוע במוניטין של הסדרה, והצהיר על אהבתו למעריצים וכמה הוא נהנה לשחק את הדוקטור.