BLAST הוא אלגוריתם מחשב שזמין לשימוש מקוון באתר המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגיה (NCBI), כמו גם באתרים רבים אחרים. BLAST יכול ליישר ולהשוות במהירות רצף DNA של שאילתה עם מסד נתונים של רצפים, מה שהופך אותו לכלי קריטי במחקר גנומי מתמשך.
האם BLAST הוא מסד נתונים ראשי?
BLAST היא התוכנה הנפוצה ביותר במחקר ביואינפורמטיקה. הפונקציה העיקרית שלו היא להשוות רצף של עניין, רצף השאילתה, לרצפים במסד נתונים large database BLAST ואז מדווח על ההתאמות הטובות ביותר, או "המגיעות", שנמצאו במסד הנתונים. לתוכנית הפשוטה הזו יש שני יישומים עיקריים.
האם NCBI הוא מסד נתונים?
ה-NCBI מכיל סדרה של מסדי נתונים רלוונטיים לביוטכנולוגיה וביורפואה ומהווה משאב חשוב לכלים ושירותים ביואינפורמטיקה.מאגרי מידע מרכזיים כוללים את GenBank לרצפי DNA ו-PubMed, מסד נתונים ביבליוגרפי לספרות ביו-רפואית. מסדי נתונים אחרים כוללים את מסד הנתונים של NCBI Epigenomics.
האם BLAST מועסק רק במסדי נתונים של NCBI?
BLAST זמין באינטרנט באתר NCBI. סוגים שונים של BLAST זמינים בהתאם לרצפי השאילתות ומסדי הנתונים של היעד.
איך עובד מסד הנתונים של BLAST?
איך BLAST עובד? BLAST מזהה רצפים הומולוגיים באמצעות שיטה היוריסטית אשר מוצאת בתחילה התאמות קצרות בין שני רצפים; לפיכך, השיטה לא לוקחת בחשבון את כל מרחב הרצף. לאחר התאמה ראשונית, BLAST מנסה להתחיל יישורים מקומיים מההתאמות הראשוניות הללו.
