יישורי רצף מרובים מספקים יותר מידע מאשר יישור זוג, מכיוון שהם מראים אזורים שמורים בתוך משפחת חלבונים שהם בעלי חשיבות מבנית ותפקודית.
מה המטרה של ביצוע יישור רצף מרובה?
בהינתן קבוצה של רצפים ביולוגיים (RNA, חלבונים, DNA), המטרה של שיטת MSA היא ליישר את הרצפים באופן שישקף את הקשר האבולוציוני, התפקודי או המבני שלהם(איור 1).
איך יישור רצף מרובה עוזר באבולוציה?
רצפים מיושרים משמשים למטרות רבות, כולל הערכה של דפוסי התבדלות, בחירה, הקצב והאופן של השינוי האבולוציוני, זיהוי של אלמנטים פונקציונליים ואילוצים והיסטוריה פילוגנטית, רק כדי להזכיר כמה.
האם יישור רצף מרובה?
יישור רצף מרובה (MSA) הוא בדרך כלל יישור של שלושה רצפים ביולוגיים או יותר (חלבון או חומצת גרעין) באורך דומה מהפלט, ניתן להסיק את ההומולוגיה קשרים אבולוציוניים בין הרצפים שנחקרו. … כלי MSA מהיר מאוד שמתרכז באזורים מקומיים.
איך נוצר יישור רצף מרובה?
אלגוריתם Clustal Omega מייצר יישור רצף מרובה על ידי תחילה ייצור יישור זוג בשיטת k-tuple לאחר מכן, הרצפים מקובצים בקבצים בשיטת mBed. לאחר מכן, שיטת ה-k-means clustering. עץ המדריך נבנה בשלב הבא בשיטת UPGMA.
